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[ Perl ]
討論串[問題]關於bioperl:::clustalW
共 11 篇文章
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這邊是因為blast演算法的關係. 一般序列比對 是利用dp (dynamic programming). 我們可以知道時間複雜度為O(n^2). 但 blast為了加速 他利用了生物的特性. 某些排列組合的sequence不會出現. 例如 ktup=3, ATT這種組合很少出現 (我亂掰的 我手邊
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Dumper是一個模組. 應該perl default會有. 台灣最近這幾年已經越來越重視bioinformatic. 你要學習這類的演算法 除了上網查之外. 也可以去做一些bioinformatic lab去借一些書來閱讀. 例如交大的黃鎮剛老師 中研院的黃明經老師. 第二種方法 你可以去上一些相
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謝謝...我大概懂你的意思了^___^. 不過這個我還沒嘗試過. 所以大概要花一點時間試試看. (刪). 這個我今天試過了. 他出現的錯誤訊息是和Dumper相關.... 好像是..我沒有Dumper這個sub吧...我沒有看的很清楚. 下次我在看指細點好了..不過如果這是和Clustalw一樣要另
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