Re: [轉錄]Re: [問題] Folding@home
基本上drug設計
是屬於docking問題
而docking是屬於NPC問題
另一個相關的問題是folding
同樣也是NPC
因此用目前電腦架構
找出來的解答 都不會有多好
例如 以folding當例子
解蛋白質結構
完全使用電腦技術 不作實驗的
不到全部的3%
因為會錯的很慘 為什麼呢?
其中一個很簡單的原因 NPC問題根本不可能找過全部的space
而藥物設計就比較難統計出比例
因為絕大部分是要廠開發 因此他們不會告訴你他的開發流程是什麼
但以在學術借來看
完全以電腦模擬設計藥物
大約有九成失敗率 因為要考量東西太多(pathway)
加上又一堆NPC問題
而NPC問題沒辦法用目前電腦解
那要怎麼辦呢
我有兩個寄於厚望的方向
一個是大家之前討論熱烈的量子電腦
我就不多說了
第二個就是學習生物 nature方法(其實量子電腦也算是利用nature力量)
因為人腦 大自然根本不會遭遇NPC
只有人設計出來的東西才有NPC
所以直接用大自然來解
在199x年就有人拿基因序列解NPC問題 而且成功
登在top journal Science上面
過幾年我在bioinformatic上面也看到antibody技術解NPC
其中更有許多大大小小篇有提到這些
有興趣的人我可以翻出來跟大家分享
※ 引述《reader (讀者)》之銘言：
: ※ [本文轉錄自 Biotech 看板]
: 作者: reader (讀者) 看板: Biotech
: 標題: Re: [問題] Folding@home
: 時間: Thu Dec 30 15:28:41 2004
: ※ 引述《reader (讀者)》之銘言：
: : 推 oplz:我有一個可能很笨的問題, 那 IBM 為甚麼不 134.174.178.197 12/30
: : → oplz:做十台 BlueGene 把他連起來變 1000 T 啊? 134.174.178.197 12/30
: IBM 是有訂單才會做的, BlueGene 是美國能源部的訂單，主要是因為
: 日本的 Earth Simulator 拿下世界第一，美國就很不爽，覺得這樣子
: 沒面子，所以能源部超級電腦中心就與 IBM 合作開發新的超級電腦。
: 這件事情就是這麼愚蠢，就是政治的關係。
: 不過 IBM 用了網格計算 (Grid Computing) 的技術，設計上可以裝配
: 65536 顆 PowerPC 的 CPU, 現在只裝配 16384 顆，還不是完整版的
: 系統，在明年才會完全組裝出來，總共 360Tflops.
: 想當然爾，弄出 360 這個數字也是為了一個好彩頭。
: 目前 BlueGene/L 已經成為 eServer 的新型號，賣出好幾台了，大多
: 用來做基因研究，不過由於價錢昂貴，其他幾台都沒有裝太多 CPU 。
: 而既然是採用網格計算的技術，理論上應該是可以外部結合多台同型
: 電腦成為更大的系統，而不必然限定在同機器上的 CPU, 只是同機器
: 可以發揮九成以上的計算能力，但不同機器卻會損失大半的計算力，
: 所以短期內應該還不會有人拿大型的超級電腦來連結。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.73.177
※ 編輯: seagal 來自: 140.109.73.177 (04/25 03:57)
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