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[問題] linux 安裝 RcppCNPy 套件

看板R_Language作者 (為什麼會流淚)時間8年前 (2017/02/14 17:04), 8年前編輯推噓0(0推 0噓 20→)
留言20則, 3人參與, 最新討論串1/1
文章分類提示: - 問題: 當你想要問問題時，請使用這個類別。 建議先利用 google 爬文，如輸入 「想查詢的關鍵字 site:www.ptt.cc/*/R_Language/」。 [問題類型]: 程式諮詢(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麼用R 寫出來) [軟體熟悉度]: 入門(寫過其他程式，只是對語法不熟悉) [問題敘述]: 我沒辦法安裝 RcppCNPy 這個套件 這個套件可以 把 r 中的 matrix 轉換到 python 的 numpy array 然後輸出 這樣我就可以用 R 做資料整理 再用 python 做 deep learning （ 因為比較熟悉 R , R 在資料整理方面很強大 ） 另外想問 轉換後 輸出是什麼樣的檔案？ 應該不是 csv 吧？ 第一次用這個 希望有幫助 error 如下 install.packages('RcppCNPy') Installing package into ‘/home/linsam/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3’ (as ‘lib’ is unspecified) % Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current Dload Upload Total Spent Left Speed 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- 0:00:01 --:--:-- 0100 132k 100 132k 0 0 80535 0 0:00:01 0:00:01 --:--:-- 80537 * installing *source* package ‘RcppCNPy’ ... ** package ‘RcppCNPy’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs I/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/include -DNDEBUG -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -I"/home/linsam/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -c cnpy.cpp -o cnpy.o sh: I/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/include: 沒有此一檔案或目錄 /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/etc/Makeconf:141: recipe for target 'cnpy.o' failed make: [cnpy.o] Error 127 (ignored) I/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/include -DNDEBUG -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -I"/home/linsam/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -c cnpyMod.cpp -o cnpyMod.o sh: I/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/include: 沒有此一檔案或目錄 /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/etc/Makeconf:141: recipe for target 'cnpyMod.o' failed make: [cnpyMod.o] Error 127 (ignored) -shared -L/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib -o RcppCNPy.so cnpy.o cnpyMod.o -lz -L/usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/lib -lR sh: line 2: -shared：命令找不到 /usr/lib64/microsoft-r/3.3/lib64/R/share/make/shlib.mk:6: recipe for target 'RcppCNPy.so' failed make: *** [RcppCNPy.so] Error 127 ERROR: compilation failed for package ‘RcppCNPy’ * removing ‘/home/linsam/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/RcppCNPy’ Warning in install.packages : installation of package ‘RcppCNPy’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpVrDA7l/downloaded_packages’ 之後我用 install_github("eddelbuettel/rcppcnpy") 直接去抓 也失敗 error如下 install_github("eddelbuettel/rcppcnpy") Error in curl::curl_fetch_disk(url, x$path, handle = handle) : Problem with the SSL CA cert (path? access rights?) [環境敘述]: linux mint 18.1 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 220.137.169.188 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/R_Language/M.1487063088.A.8B6.html
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02/14 19:03, , 1F
好奇問，R的deep learning不好嗎?
02/14 19:03, 1F
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02/14 21:12, , 2F
你用Microsoft R Open，他沒有C++11的falg
02/14 21:12, 2F
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兩個方法，一個用原版R，另一個改
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R.home()/etc/Makeconf
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感謝 那就把 r open 刪掉 裝一般的 另外 R 中的 deep learning 沒有研究 我只知道 mxnet R 裡面好像也有 tensorflow 因為一般聽到的 都是用 python 做 deep learning 如果可以用R做 那我會很開心的 ================================================ 聽說 python 也是 call java or c++ 做deep learning 所以只要等別人做出 R 的接口 以後可能直接用R做就好了 ※ 編輯: f496328mm (220.137.169.188), 02/14/2017 21:17:32
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02/14 21:35, , 5F
github沒裝成功是因為你linux沒裝libcurl
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02/14 21:35, , 6F
但是github一樣要編譯，所以用MRO一樣會死
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libcurl這個是 r 的 packages 嗎？ ※ 編輯: f496328mm (220.137.169.188), 02/14/2017 22:43:17
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02/14 22:53, , 7F
linux的
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我安裝 sudo apt-get update sudo apt-get install curl sudo apt-get install libcurl3 還是不能 install_github 耶 ※ 編輯: f496328mm (220.137.169.188), 02/14/2017 23:06:27
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02/14 23:30, , 8F
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02/14 23:31, , 9F
sudo apt-get install curl libcurl3-dev
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有人做 Tensorflow 的 R binding，基本上，就是 call
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remove.package(c("curl", "RCurl"))
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原來那個 Tensorflow。就自行參考囉
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install.package(c("curl", "RCurl"))
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就可以用了
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但是rstudio的tensorflow其實就只是寫python....
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還是不如直接轉出去call python script直接做
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歹勢沒看到 c 大在推文... C 大說得也對，這個包得
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不太好用...
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沒事XDD
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我目前也傾向用python做deep learning 就看未來R在這塊發展的如何 ※ 編輯: f496328mm (220.137.169.188), 02/14/2017 23:37:30
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我只覺得rstudio這個套件沒什麼用的感覺QQ
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我也不喜歡 rstudio 以前在windows都是用gui界面 只是 linux 沒有界面 所以只好用 rstudio install.packages("RcppCNPy") 成功拉 感謝 celestialgod 大 ※ 編輯: f496328mm (220.137.169.188), 02/15/2017 00:08:41
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