[問題] Biopython處理Genbank file

看板Python作者 (je ne sais quoi)時間14年前 (2011/04/23 14:05), 編輯推噓0(000)
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不知道Biopython的問題合不合適 請教板上各位高手 小弟是Biopython新手 很多語法都不熟悉 輸入一個.gbk檔 從中找出tRNA資訊 (ACCESSION number,第幾個tRNA,product還有抓出sequence) 並印出到FASTA file中 如下 >NR12345, tRNA 1, tRNA-Glu ACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTACGTGTACGTCCCCGGGGAT GCTCTAAGCAACGTGTACGT >NR12345, tRNA 2, tRNA-Met CCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATCCCCGGGGATATATCGGGAA CCTGACGTTGCCTGACGTTG 目前以寫到可以抓出ACCESSION number,product以及序列所在位置(起迄點) 可是不知道要怎麼去序列裡抓出來 希望板上biopython的高手可以相助 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.153.200.39
文章代碼(AID): #1Dicmh5w (Python)
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