Re: [問題] 想請問一個生物資訊問題 如何找ㄧ串mo …
※ 引述《fuu0115 (風)》之銘言：
: ※ 引述《mzac1b (Goodday)》之銘言：
: : --------------------------------------
: : [問題]
: : 蛋白質序列 -------------motif--motif--motif--motif--motif-----------
: : 其中motif 與motif 間隔約10 個胺基酸
: : 且一個蛋白質可能不只一串motif
: : 我要取每一串的第一個motif 那要怎麼寫呢 ??
: : --------------------------------------
: : 我學perl 一個多月
: : 主要看 Beginning perl for bioinformaitcs
: : 這本書只有講用
: : $protein =~ /$motif/
: : 來找含 motif 之蛋白
: : 我聽說能直接指定一串motif中我要的第n 個
: : 懇請賜教~~~~
: 直接取第一個motif
: $seq = "-----------motif--motif--motif";
: $motif = "xxx";
: print $1 if($seq =~/($motif)/) #取第一個結果並印出
: 要取第n個
: @motifs = ($seq =~/$motif/g);
: print $motif[$n-1]; #取第n個結果印出
轉眼過一個月了
先感謝風大大
再請問 ^^"
取下motif 之後
如何能知道該 motif 的第一個胺基酸是
整個蛋白的第幾個胺基酸??
thx a lot ~
--
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