Re: [問題] 想請問一個生物資訊問題 如何找ㄧ串mo …

看板Perl作者 (風)時間19年前 (2006/04/28 15:43), 編輯推噓0(000)
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※ 引述《mzac1b (Goodday)》之銘言: : -------------------------------------- : [問題] : 蛋白質序列 -------------motif--motif--motif--motif--motif----------- : 其中motif 與motif 間隔約10 個胺基酸 : 且一個蛋白質可能不只一串motif : 我要取每一串的第一個motif 那要怎麼寫呢 ?? : -------------------------------------- : 我學perl 一個多月 : 主要看 Beginning perl for bioinformaitcs : 這本書只有講用 : $protein =~ /$motif/ : 來找含 motif 之蛋白 : 我聽說能直接指定一串motif中我要的第n 個 : 懇請賜教~~~~ 直接取第一個motif $seq = "-----------motif--motif--motif"; $motif = "xxx"; print $1 if($seq =~/($motif)/) #取第一個結果並印出 要取第n個 @motifs = ($seq =~/$motif/g); print $motif[$n-1]; #取第n個結果印出 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.166.240
文章代碼(AID): #14KSUQXn (Perl)
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