Re: [問題] 算蛋白質長度
看板RegExp (正規表示式 Regular Expression)作者supertitler (好難OO)時間16年前 (2008/08/26 14:00)推噓1(1推 0噓 1→)留言2則, 2人參與討論串2/2 (看更多)
先說一下我的假設
你有一個檔案像這樣
: >sp|P15711|104K_THEPA 104 kDa microneme/rhoptry antigen OS=Theileria parva GN=TP04_0437 PE=2 SV=100
以>來區隔每個蛋白質，而後是蛋白質的metadata(?)
metadata中不會出現\n，最後以換行作結束
如果是這樣的話
: 每個蛋白質都由 >sp 隔開，我想算中間那段有多少char，
: 不知怎麼下 expression ?
要算中間那段資料有多少字元，先取出字串，再看長度多少囉
我的作法是(\n[^>]*)，如此可以取得中間的那段資料
至於中間的資料有換行的部份可以直接取代成空白就好
然後看你用什麼語言，去得到字串長度
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※ 編輯: supertitler 來自: 220.129.169.253 (08/26 14:56)
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08/27 10:50, , 1F
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