[問題] 請問如何隨機截取一段序列?

看板Perl作者 (Goodday)時間18年前 (2007/03/22 13:50), 編輯推噓2(201)
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各位大大好 小弟我最近在用perl 做氨機酸序列的分析 我學過的perl書只有 "begining perl for bioinformatics" 我想測試某個計分方式 對於 "指定的 motif" 與 "隨機挑選之序列" 是否有明顯的差異 請問: 如何從一群蛋白質序列 (約30000 個蛋白質序列) 由其中隨機挑選出任意一個蛋白質任意一段連續的短序列 ( ~30a.a. 的短序列) 我想挑選 5000 段隨機的短序列 請問這樣要怎麼寫 先感謝不吝賜教~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.55.227

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substr($dna, int(rand(length($dna)+1-30)), 30)
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樓上正解 XDD
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說真的我覺得 Learning perl 比 原PO說的那本書好用
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文章代碼(AID): #160Xaxie (Perl)
文章代碼(AID): #160Xaxie (Perl)