[請益] 有關基因序列
請教各位高手
我現在有一段基因序列
假設是"ATCGAATTCG GCTACTAGCTA TTAGCCCTAA GCGTAAATCG AT"
然後我想設一個長度為 10 個字母的 moving frame 從第一個字母往下一個一個移動檢查
一旦遇到在這個 frame 裡面 "CG" 含有兩個以上 就把這個 frame 回傳
以本序列為例
應該會有以下5個符合的結果:
1. "ATCGAATTCG" (起始位置為第1個字母)
^^ ^^
2. "TCGAATTCGG" (起始位置為第2個字母)
^^ ^^
3. "CGAATTCGGC" (起始位置為第3個字母)
^^ ^^
4. "GCGTAAATCG" (起始位置為第31個字母)
^^ ^^
5. "CGTAAATCGA" (起始位置為第32個字母)
^^ ^^
小弟我已經翻遍了 Learning Perl
似乎也沒有介紹到與我想要做的事情相關的內容
但我仍覺得 perl 應該還有什麼較方便的函式可以來幫忙處理才對
不曉得各位高手是否能夠指點小第一二? 先向大家謝過了~
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