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Re: [菜單] 數值分析用電腦

看板PC_Shopping (個人電腦購買)作者 (米漢堡)時間3月前 (2024/08/07 00:18), 編輯推噓43(43推 0噓 51→)
留言94則, 41人參與, 3月前最新討論串2/2 (看更多)
原文刪光光 由於前一篇回答此類問題是2019年，也還在這個領域工作就乾脆更新一下 數值分析套裝軟體很多種， 常見有ANSYS LS-DYNA ABAQUS Fluent COMSOL這類泛用型物理模擬 也有許多化學類的模擬軟體(我不熟) 而這類軟體的核心都是從"解偏微分方程式"這個目標衍伸而來的 其運作流程是 1. 幾何資訊(CAD)離散化，也就是俗稱的切網格 2. 矩陣組合，解反矩陣，這是所謂的求解計算 3. 結果產出 如何配置一台符合預期的計算主機也可從上面3點一一解釋 1.切網格部分目前絕大多數軟體都是自動切分網格，使用者只需要手動 輸入一個尺寸(最多再輸入最小尺寸)，軟體會自動鋪設並且還會製作過度元素 這在20~30年前是想不到的功能，我公司前輩講古說因為以前記憶體不夠大 大概是配個512MB到1G，工程師會覺得公司好捨得給我好的電腦配備 因為網格數量會直接佔用記憶體，即使是矩陣0區不計算也會劃分空間留用 所以老工程師會手動製作網格，用各種花式手法去製作精良(品質良好)的網格 甚至會簡化原始模型，例如拿掉不重要區域的導R角， 然後把 "mesh is art" 這句話掛在嘴邊(一臉秋樣)， 其這些手法都是為了降低記憶體使用，因為矩陣大於記憶體是不能計算的 軟體方因應方法曾開發了一個 swaping 功能，其實就是把硬碟當記憶體用， 來避免"不能算"的狀況發生，也能想像到這樣的計算速度會有多慢了 但算得慢總比不能算來得好，至於手動製作網格學習成本太高，也不會有妹子 在你旁邊說 哇你網格好強喔 手動做三天，自動只要3分鐘　所以不建議學這個 現在王道就是自動網格然後買大記憶體+高時脈多核心CPU硬幹就是了 所以記憶體選擇越快越好，買到多大取決於你的模型有多大， 不知道模型會有多大，那就買滿現在能插滿的 2.矩陣求解部分，這個需要看題目，簡單說就是如果是一般大小的線性題目基 本上幾分鐘到幾十分鐘就會解完了，阿就解一步反矩陣是會多慢，如果是頻率 域算太久，你要先想是不是選錯掃頻策略 所以這部分會預先假設做的題目是時域非線性(學術上才稱得上有一些些難度)， 在非線性求解過程，會有非常多步的迭代跟時間增量步，簡單說就是會一直try 解反矩陣~驗證收斂性~反覆做，在這個步驟CPU效能是吃滿的，所以CPU的時脈 直接決定了解題快慢 基於這個架構要談幾件事： a. 核心數不等於執行緒，這個是某家起的壞榜樣，超執行緒(Hyper Threading) 技術是~我賭你使用電腦時不會一直讓CPU很忙碌，所以我把一個核心模擬成 兩個核心，這樣看起來框框超多的，賣相很好 很抱歉，在模擬過程還真是CPU滿載，所以16C/32T開啟平行32核，你會發現一件 神奇的事情，原本要加速反而速度變更慢，因為資源互搶了 b. 快取的重要性，因為使用到平行計算功能(intel MPI/MS MPI)，在數據的吞 吐頻率跟資料大小，因為軟體不同也不甚熟悉無法詳述，依照之前資工資源 班上課老師說的~快取buffer是預先讀取前後幾十行的程式碼，讓使用者操作 不卡頓，在計算上SMP平行計算效能是會集中調配使用，這部分快取就很重要 我也實測過，快取越多效率越好，快取像便宜白菜給的AMD，我只能給個讚 c. 時脈，CPU規格上面會有兩種時脈，一個是基本時脈，另一個是turbo時脈 turbo時脈講的是單核使用時的極限，還可能根據體質以及散熱而無法達到此值 所以在使用上建議買32C/64T 滿載最多用到16C 我這邊上上個月配的 TR 7980 32C/64T (5.3 / 4.0 GHz) 測試非線性物理專用型CAE 32C 4.2 ~ 4.5 GHz (常時 4.2 GHz) 16C 4.8 ~ 5.0 GHz (常時 4.8 GHz) 基本上會跳動偏高，觀察懷疑是迭代完成準備存取下一步時的喘息時段 所以原PO買了7985也不用煩惱，測測看 32C/64C 再決定要不要開滿 3.結果產出部分，就是把計算完的某個時間點結果存到硬碟 這時取決的就是硬碟寫入速度了， 其實這二十年來電腦硬體進步神速，記憶體便宜又大，CPU核心數比前女友還多 最後還是被硬碟速度拖到，在SSD還沒普及的時候，算一個非線性題目常是2天 起跳，當裝了SSD後同題目竟然可以剩下10多小時，可見硬碟寫入速度有多拖 沓，現在 Gen 4 到 Gen 5 才隔沒幾年，這種進步速度讓我期待接下來的發展 當然也可以在軟體設定上面減少結果存檔數量也能做到加速的效果，但不保證 會不會漏看甚麼重要的物理現象 上禮拜計算的一個題目檔案存了100多Gb算是特例，但是5Gb~10Gb應該是跑不掉 然後還是要提醒一下 SSD 做 RAID 只有讀取有加速受惠，寫入沒有 結論： 必要零件選用優先度 1. RAM 決定了能計算的題目大小，有餘裕就買滿 2. CPU 時脈越高越好>核心數(取決使用的軟體)>快取 3. 硬碟讀取寫入(特別是寫入)速度越快越好， 然後容量大小評估一下，或是習慣常清空間 其他零組件 CPU水冷必備，跑個題目可能要幾天，你也不希望熱當機重跑吧 顯卡看模型結果複雜度(解析度/網格數)，網格太多可能會卡頓，選個vram多的 不用繪圖卡 另外以上只是大方向並非絕對，特別是題型或學術領域不同可能差異很大 也歡迎其他大大補充 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 36.224.253.101 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/PC_Shopping/M.1722961134.A.09B.html
推
08/07 00:24, 3月前 , 1F
專業推 看不懂(X
08/07 00:24, 1F
推
08/07 00:25, 3月前 , 2F
推分享
08/07 00:25, 2F
推
08/07 00:27, 3月前 , 3F
推 以前看學長跑熱傳模擬PC上貼
08/07 00:27, 3F
→
08/07 00:27, 3月前 , 4F
動我PC就殺人 實在是要好久XD
08/07 00:27, 4F
推
08/07 00:34, 3月前 , 5F
推，想到以前實驗室跑模型也是等到唉唉
08/07 00:34, 5F
→
08/07 00:34, 3月前 , 6F
叫
08/07 00:34, 6F
推
08/07 00:42, 3月前 , 7F
模擬計算真的是優先RAM越大越好 矩陣都存
08/07 00:42, 7F
→
08/07 00:42, 3月前 , 8F
在RAM裡 尤其體系一旦大起來RAM不夠的話
08/07 00:42, 8F
→
08/07 00:42, 3月前 , 9F
直接job crash給你看
08/07 00:42, 9F
推
08/07 00:46, 3月前 , 10F
什麼都好 就是不要選intel cpu
08/07 00:46, 10F
→
08/07 01:41, 3月前 , 11F
把HT關了會比較快嗎
08/07 01:41, 11F
推
08/07 01:45, 3月前 , 12F
推，真專業心得
08/07 01:45, 12F
推
08/07 02:40, 3月前 , 13F
專業
08/07 02:40, 13F
推
08/07 03:53, 3月前 , 14F
看完發現其實我不需要5950x 只是想要
08/07 03:53, 14F
推
08/07 04:10, 3月前 , 15F
HT的優勢還是在多工
08/07 04:10, 15F
推
08/07 04:27, 3月前 , 16F
大推 感謝分享 各式各樣瓶頸 碰過才知道
08/07 04:27, 16F
推
08/07 05:27, 3月前 , 17F
在你旁邊說 哇你網格好大喔
08/07 05:27, 17F
推
08/07 06:23, 3月前 , 18F
推。
08/07 06:23, 18F
推
08/07 07:18, 3月前 , 19F
專業
08/07 07:18, 19F
推
08/07 07:30, 3月前 , 20F
08/07 07:30, 20F
推
08/07 08:16, 3月前 , 21F
專業
08/07 08:16, 21F
推
08/07 08:19, 3月前 , 22F
感謝專業分享。
08/07 08:19, 22F
推
08/07 08:40, 3月前 , 23F
感謝分享
08/07 08:40, 23F
推
08/07 08:56, 3月前 , 24F
推推
08/07 08:56, 24F
→
08/07 09:39, 3月前 , 25F
回PS3:我測試HT關影響不大,而且現在有些
08/07 09:39, 25F
→
08/07 09:39, 3月前 , 26F
U或板是不給關的,我也遇過amd關了不穩定
08/07 09:39, 26F
→
08/07 09:51, 3月前 , 27F
不能用上gpu嗎？精度問題？
08/07 09:51, 27F
→
08/07 10:07, 3月前 , 28F
不行,是算法問題,一些軟體大廠有朝GPU加
08/07 10:07, 28F
→
08/07 10:08, 3月前 , 29F
速方向去研發,但是效果差強人意大約加快
08/07 10:08, 29F
→
08/07 10:08, 3月前 , 30F
0~7%且題型限定無法通用,除非演算法打掉
08/07 10:08, 30F
推
08/07 10:08, 3月前 , 31F
推 ram多多益善 swap會把ssd操壞qq
08/07 10:08, 31F
→
08/07 10:09, 3月前 , 32F
全部重來,或是高手橫空出世一個新的邏輯
08/07 10:09, 32F
→
08/07 10:10, 3月前 , 33F
可以無痛轉移,不然都是所謂的技術包袱
08/07 10:10, 33F
推
08/07 10:17, 3月前 , 34F
mi300a號稱只跑solver matrix就能快4
08/07 10:17, 34F
→
08/07 10:17, 3月前 , 35F
倍 可惜生態還沒起來沒法驗證通用性
08/07 10:17, 35F
推
08/07 10:19, 3月前 , 36F
GPU運算 ==> 要看計算模擬軟體支援
08/07 10:19, 36F
→
08/07 10:20, 3月前 , 37F
推這篇, 其實RAM是最最最最最最重要的
08/07 10:20, 37F
→
08/07 10:20, 3月前 , 38F
CPU其次.
08/07 10:20, 38F
推
08/07 10:25, 3月前 , 39F
推推，做CFD的對切網格的時代變遷深有同
08/07 10:25, 39F
→
08/07 10:25, 3月前 , 40F
感
08/07 10:25, 40F
→
08/07 10:26, 3月前 , 41F
還在當學生的時候要東調西調才能切出品
08/07 10:26, 41F
→
08/07 10:26, 3月前 , 42F
質還可以的網格，現在都一鍵生成了
08/07 10:26, 42F
→
08/07 10:27, 3月前 , 43F
GPU運算用在某些情境上還會讓算的時間變
08/07 10:27, 43F
→
08/07 10:27, 3月前 , 44F
久
08/07 10:27, 44F
推
08/07 10:44, 3月前 , 45F
25年前用icemcfd切風扇的六面體網格路過
08/07 10:44, 45F
→
08/07 10:54, 3月前 , 46F
手切大約一星期，當時覺得自己好偉大...
08/07 10:54, 46F
推
08/07 10:55, 3月前 , 47F
配備夠好瓶頸就在I/O XD
08/07 10:55, 47F
→
08/07 10:56, 3月前 , 48F
各家軟體8thread以上邊際效益就遞減
08/07 10:56, 48F
→
08/07 10:56, 3月前 , 49F
16以上幾乎就沒差 有的反降XD
08/07 10:56, 49F
→
08/07 10:56, 3月前 , 50F
跑有限元素分析建議HT/SMT關一關
08/07 10:56, 50F
推
08/07 10:58, 3月前 , 51F
系統用Win11/Server2022
08/07 10:58, 51F
→
08/07 10:59, 3月前 , 52F
不要手動介入CPU調用 讓系統處理
08/07 10:59, 52F
推
08/07 11:33, 3月前 , 53F
關SMT不穩更新BIOS NUMA設AUTO44
08/07 11:33, 53F
推
08/07 14:18, 3月前 , 54F
寫入重要就買optane
08/07 14:18, 54F
推
08/07 15:10, 3月前 , 55F
好奇問SSD raid寫入沒有加成真的嗎？
08/07 15:10, 55F
→
08/07 15:10, 3月前 , 56F
是主版直連還是HBA卡ZFS
08/07 15:10, 56F
→
08/07 15:10, 3月前 , 57F
還是Hardware RAID controller？
08/07 15:10, 57F
推
08/07 15:45, 3月前 , 58F
專業推 雖然根本看不懂
08/07 15:45, 58F
推
08/07 16:21, 3月前 , 59F
推 專業
08/07 16:21, 59F
推
08/07 17:20, 3月前 , 60F
大CASE算到後來都在等資料交換XD
08/07 17:20, 60F
推
08/07 17:41, 3月前 , 61F
我自己在用MS，化學的軟體， 很常開好多
08/07 17:41, 61F
→
08/07 17:41, 3月前 , 62F
個運算看工作管理員記憶體才用一半但整個
08/07 17:41, 62F
→
08/07 17:41, 3月前 , 63F
程式會直接卡死，這是cpu的問題還是記憶
08/07 17:41, 63F
→
08/07 17:41, 3月前 , 64F
體
08/07 17:41, 64F
→
08/07 18:12, 3月前 , 65F
偶遇過程式malloc一堆空頁再free結果
08/07 18:12, 65F
→
08/07 18:12, 3月前 , 66F
vm碎到pagefile占>10%的 這樣會ram c
08/07 18:12, 66F
→
08/07 18:12, 3月前 , 67F
pu都沒滿就卡爆 唯一解是重開機orz
08/07 18:12, 67F
推
08/07 18:26, 3月前 , 68F
有時候pagefile重設可以解決
08/07 18:26, 68F
→
08/07 18:26, 3月前 , 69F
不知道是bug還是剛好配在弱磁區?
08/07 18:26, 69F
推
08/07 19:30, 3月前 , 70F
感謝分享 條理分明還有實測結果
08/07 19:30, 70F
推
08/07 19:42, 3月前 , 71F
好懷念噢
08/07 19:42, 71F
→
08/07 19:43, 3月前 , 72F
以前老師都只買Intel的cpu直到我自己
08/07 19:43, 72F
→
08/07 19:43, 3月前 , 73F
買一顆3900X跟他說這個快很多才肯買A
08/07 19:43, 73F
→
08/07 19:43, 3月前 , 74F
MD
08/07 19:43, 74F
推
08/07 19:49, 3月前 , 75F
GPU加速只有流體比較有用，固力模擬不會
08/07 19:49, 75F
→
08/07 19:49, 3月前 , 76F
加快多少
08/07 19:49, 76F
推
08/07 20:59, 3月前 , 77F
時脈是不是要考慮IPC？
08/07 20:59, 77F
推
08/07 21:00, 3月前 , 78F
謝謝
08/07 21:00, 78F
推
08/07 22:22, 3月前 , 79F
推
08/07 22:22, 79F
推
08/08 10:45, 3月前 , 80F
水冷是單台機器個人用才可以這樣搞吧
08/08 10:45, 80F
→
08/08 10:45, 3月前 , 81F
，多台光保養就搞死人
08/08 10:45, 81F
→
08/08 10:53, 3月前 , 82F
To joverKJ:幾年前用過 Material Studio
08/08 10:53, 82F
→
08/08 10:54, 3月前 , 83F
這套模組算法很多樣, 我簡易測試過軟體
08/08 10:54, 83F
→
08/08 10:55, 3月前 , 84F
多開穩定性要問廠商,或是存取寫入拖到
08/08 10:55, 84F
→
08/08 10:56, 3月前 , 85F
我懷疑是前者,也許是多開造成互搶資源
08/08 10:56, 85F
推
08/08 12:37, 3月前 , 86F
專業推
08/08 12:37, 86F
→
08/08 12:44, 3月前 , 87F
跑非線性多網格運算很容易吃滿100%導致整台
08/08 12:44, 87F
→
08/08 12:44, 3月前 , 88F
電腦會卡住，所以通常執行緒不會全開
08/08 12:44, 88F
推
08/10 04:26, 3月前 , 89F
做CFD做了十幾年，深刻認爲自動生成網格
08/10 04:26, 89F
→
08/10 04:26, 3月前 , 90F
對做正事來說沒什麼用。當cpu變快ram變
08/10 04:26, 90F
→
08/10 04:26, 3月前 , 91F
大，就想去解更複雜的題目，到頭來還是
08/10 04:26, 91F
→
08/10 04:26, 3月前 , 92F
要去手動調整domain內所有的網格設定。
08/10 04:26, 92F
→
08/10 04:26, 3月前 , 93F
不過現在都直接用自己寫code放到HPC系統
08/10 04:26, 93F
→
08/10 04:26, 3月前 , 94F
去跑就是了
08/10 04:26, 94F
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