Re: [菜單] Gaussian 03 模擬計算用PC

看板PC_Shopping (個人電腦購買)作者touyalin (叭噗人)時間16年前 (2008/11/06 15:07)推噓7(7推 0噓 1→)

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※ 引述《sonyc503 (燃燒吧我的小宇宙)》之銘言： : 看你的IP 應該跟我一樣在同一棟大樓 : 如果你真的要跑Gaussian03 就算配上Intel最快的i7還是要算很久很久..... : 而且要裝Linux版的Gaussian不是件容易的事 @@ : 如果你們老師有國科會計畫的話 : 建議直接申請新竹國家高速計算中心的Cluster來用比較省時省力 : 像是 Hp Superdome、IBM Cluster1350 都是很好的選擇 : 像我用來丟Gaussian03 JOB的電腦只要能開KKMAN就能丟了 :P : PC要算一星期的東西丟上去Cluster幾小時或幾分鐘就算完了 : 不過如果能跟老師凹到拿i7來開KKMAN或PCMAN也是很爽的事啦 XD : 一點建議給你參考參考裝linux版的gaussian 03 並不會很難，家目錄下的.login 或是/etc/profile 設定好 path 就可以跑了。在linux下平行處理的效能都比 windows下要好上太多，也因此我們計算工作站都是 linux 系統，此外， gaussian 03 也可以用 compilier (特別是 intel 出的)來最佳化，大約會再增加 10% 左右的效能。至於高速電腦中心的cluster，我們實驗室有申請 IBM 1350, IBM P690, P690A, HP 64bit cluster, Formosa II HPC cluster,AMD 16P 等這幾台 cluster 的使用帳號，不過上述機器都有 cpu time 的限制。不可否認的，在高速電腦中心用來跑小分子系統的確是滿快的，但是大分子系統可能連一個 link (特別是link 1002) 都沒辦算完就會被系統 kill 掉，而且 gaussian 03 需要算完一個 link 才能 restart，因此對我們而言大分子系統的計算，只能在實驗室的機器上完成。當然，計算時間與所使用的計算方法有很大的關連性，我不確定您是在何種 level 下計算您的系統，在 pc 上跑一星期，到高速電腦中心算只要幾小時或幾分鐘算完，我個人覺得有點誇張就是了，除非您的 pc 是很舊的機器。以我自己的經驗來說， Q6600 與高速電腦中心同樣以 4 cpu 來計算同一個 job，其實速度上是不會差異太大的。會這麼期待這一次 intel 的i7，大部份網路上的評測都說明 i7 具有強大的效能與計算能力，建置一台 i7 的系統也遠比建置一台雙路Xeon的系統要來的便宜多了， Xeon E5440*2 的工作站就要 150k， i7 大約 50k， Q6600 大約 25k，如果 i7 可以跟前一代 Xeon 效能打平或是接近的話，其價格效能比是相當不錯的。 ps: 買 i7 來開 pcman 來丟 job 實在太浪費了。囧rz -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.120.9.221