[閒聊] 恭喜開版!
先恭喜開版!
雲端計算算是一個包容廣泛的名詞,然而以一個生物資訊user的角度
實在無法提供言之有物的文章,只能大概述說像我們這種使用者所在
意的點在哪裡。首先,我們實驗室是一個生物實驗室,主要都是在培
養細胞,取出其中的生物分子進行分析。近幾年來,由於基因定序技
術的發展與普及,敝實驗室開始對新一代定序技術產生興趣,也買了
幾台IBM x3650開始進行分析。雖然目前已經有不少組織有提供寫好
的介面以及服務可以使用(例如http://main.g2.bx.psu.edu/),但
是我們偶爾會覺得這樣的介面還不符合需求,而也會想要自行開發合
用的軟體,又由於新一代定序技術產出的資料量很大,所以會需要較
一般消費級電腦更多的資源(例如32GB RAM, ~5TB RAID storage)。
對於一個以生物學研究法為主的實驗室,機器的維護更新會是一個很
頭痛的問題(目前是由有興趣玩弄伺服器/被伺服器玩弄的學長跟我在
撐著,但是老師說擔心畢業了該怎麼找人幫忙。)這時候能夠有人幫
忙管機器,而我們只要負責好軟體的維護開發,可說是解決了一部分
的問題。(對我來說,能夠解決這些問題的話,畢業機率也大增阿!)
所以我這個有點power但又不太power的user比較在意的問題是
服務提供者能否讓我們把已經開發好的環境直接丟上機器執行,像是
amazon就可以由磁碟映像開機,如此我可以直接把我們的機器做成映
像檔就可解決,而儲存跟網路頻寬的部份就單純是c/p值的問題了。
為什麼不用amazon的服務呢?因為網路速度還是太慢了。所以我們是
希望能夠找到在台灣有主機,且是與TANet有高速連線的服務提供者
,當然如果對學術單位有打折的話就更好了。不過這樣子好像符合的
單位很少就是了。
一點最近的心得淺見與大家分享,如有什麼建議也還請指教,謝謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
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推
08/02 16:18, , 1F
08/02 16:18, 1F
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