[問題] openMP與MPI的問題
( *[1m *[m 為色碼,可以按 Ctrl+V 預覽會顯示的顏色 )
( 未必需要依照此格式,文章條理清楚即可 )
遇到的問題: (題意請描述清楚)
我主要程式是R(統計軟體)與C組成的
想把c檔改成可平行的方式運作,使用兩種平行方式openMP與mpi
以下是執行過程:
.c檔=>.o檔=>.so檔=>給R使用
希望得到的正確結果:
在沒有使用openMP與MPI下,可以執行完畢
但加入openMP或mpi的指令後會有錯誤
程式跑出來的錯誤結果:
加入openMP指令後
會產生KMEANS_RLCA.so: undefined symbol: GOMP_parallel_end
加入mpi指令後
會產生KMEANS_RLCA.so: undefined symbol: MPI_Finalize
都是在R在load .so檔時發生的錯誤
開發平台: (例: VC++ or gcc/g++ or Dev-C++, Windows or Linux)
linux gcc4.3.2
有問題的code: (請善用置底文標色功能)
補充說明:
openMP方面在想是不是沒有抓到libgomp資料庫
但是不知道怎樣可以順利抓到
mpi方面 MPI_Init(),MPI_Finalize(),MPI_Comm_size(),MPI_Comm_rank()
一定要放在main程式裡面嗎?
因為我的c檔沒有主程式,都是副函數給R call使用的
拜託版上高手解救了!!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.113.114.213
推
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